El 5 de noviembre de 1989, Santi Aragón debutó en partido de liga como jugador del CD Logroñés frente al Mallorca (0-1) en Las Gaunas y lo hizo ‘con nota alta’, según la prensa. Cedido por el Real Madrid, junto a Rosagro, Vílchez y Maqueda, a raíz del fichaje de Ruggeri, fue convocado por Chus Pereda y, el día 14, se estrenó con la Selección Española Sub-21 ante Hungría en los octavos de final de la Eurocopa.