A sus 16 años, Javi Zubillaga fue el jugador más destacado del torneo juvenil del Berceo en 1975. El CD Logroñés se interesó por él, pero fichó por la Real Sociedad para su cantera y llegó a ser internacional sub-18. El 1 de febrero de 1981, tal día como hoy hace 40 años, jugó en Las Gaunas con el Sanse y, luego, dio el salto al primer equipo donostiarra a finales de 1981. De 1998 a 2000, fue coordinador deportivo del Logroñés.